«ولايت تكوينى» امام معصوم(ع) در آيات متعدد قرآن اثبات شده است. به تصریح قرآن کسی که عارف به علم الکتاب باشد می تواند در طبیعت تصرف و دخالت کند و شرط دستیابی به آن قرار گرفتن در زمره ی «مطهرون» است و مصداق آن در آیه تطهیر بيان شده است: «خدا چنين مى خواهد كه هر رجس و پليدى را از شما خاندان نبوت دور سازد و شما را از هر عيبى پاك و منزه گرداند». امام باقر(ع) می فرمایند: «منظور این آیه فقط ما[معصومین(ع)] هستیم».

پیامبر(ص) و امام، در مدت حیات خود باید آن چنان احکام الهى را بیان و اجرا کنند که جوابگوى تمام نیازمندهاى انسان ها در هر زمان و مکانی باشد و این ممکن نیست مگر آن که از اسرار غیب آگاه باشد. همچنین با توجه به آیات 40 سوره نمل، 43 سوره رعد و 89 سوره نحل، موضوع علم غیب پیامبر(ص) و امامان(ع) روشن مى شود.